Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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C9orf135Q5VTT2 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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C9orf135Q5VTT2 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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C9orf135Q5VTT2 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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C9orf135Q5VTT2 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
C9orf135Q5VTT2 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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