Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
GEN1Q17RS7 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
GEN1Q17RS7 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.2 ms