Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CDKN3Q16667 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms