Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
HERC1Q15751 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
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