Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SYCP1Q15431 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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