Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL1Q13616 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL1Q13616 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL1Q13616 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms