Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
TUBB3Q13509 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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TUBB3Q13509 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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TUBB3Q13509 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TUBB3Q13509 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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