Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
XRCC4Q13426 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
XRCC4Q13426 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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