Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MSLNQ13421 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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