Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ITGB3BPQ13352 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ITGB3BPQ13352 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ITGB3BPQ13352 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
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ITGB3BPQ13352 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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ITGB3BPQ13352 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
ITGB3BPQ13352 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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