Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TRAF3Q13114 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms