Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
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CHAF1AQ13111 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
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CHAF1AQ13111 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1AQ13111 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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