Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
GRIK2Q13002 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms