Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXD4Q12950 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms