Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
J3QKU1 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
J3QKU1 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
J3QKU1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
J3QKU1 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
J3QKU1 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
J3QKU1 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
J3QKU1 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms