Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5538W4VSP6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm5538W4VSP6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Gm5538W4VSP6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm5538W4VSP6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Gm5538W4VSP6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm5538W4VSP6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5538W4VSP6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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