Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17190V9GX38 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms