Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Top3bQ9Z321 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms