Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubl3Q9Z2M6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ubl3Q9Z2M6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms