Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn6Q9Z262 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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