Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sema4fQ9Z123 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sema4fQ9Z123 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms