Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Xpr1Q9Z0U0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xpr1Q9Z0U0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms