Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn9Q9Z0S7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Cldn9Q9Z0S7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn9Q9Z0S7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cldn9Q9Z0S7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn9Q9Z0S7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms