Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nme3Q9WV85 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms