Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atp1a4Q9WV27 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms