Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU60

Atrn, Attractin, mousemouse

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrnQ9WU60 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AtrnQ9WU60 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AtrnQ9WU60 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms