Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Pus1Q9WU56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Pus1Q9WU56 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Pus1Q9WU56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pus1Q9WU56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pus1Q9WU56 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pus1Q9WU56 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pus1Q9WU56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms