Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nrf1Q9WU00 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms