Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp18Q9WTV6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp18Q9WTV6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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