Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed2Q9R0Q3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms