Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AmfrQ9R049 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms