Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Npas3Q9QZQ0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Npas3Q9QZQ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Npas3Q9QZQ0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Npas3Q9QZQ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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