Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trpc3Q9QZC1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trpc3Q9QZC1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms