Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pkp3Q9QY23 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pkp3Q9QY23 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms