Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cbx8Q9QXV1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cbx8Q9QXV1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms