Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ChmQ9QXG2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmQ9QXG2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms