Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chaf1aQ9QWF0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chaf1aQ9QWF0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms