Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nectin3Q9JLB9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms