Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmod2Q9JKK7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms