Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms