Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ybx3Q9JKB3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ybx3Q9JKB3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms