Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ube2j1Q9JJZ4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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