Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alyref2Q9JJW6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Alyref2Q9JJW6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Alyref2Q9JJW6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Alyref2Q9JJW6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Alyref2Q9JJW6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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