Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scube2Q9JJS0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scube2Q9JJS0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms