Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efcc1Q9JJF6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Efcc1Q9JJF6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efcc1Q9JJF6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms