Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad9Q9JIW5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smad9Q9JIW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms