Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmbr1Q9JIT0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms