Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ClpxQ9JHS4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ClpxQ9JHS4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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