Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn19Q9ET38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Cldn19Q9ET38 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Cldn19Q9ET38 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn19Q9ET38 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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