Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pgpep1Q9ESW8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgpep1Q9ESW8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms